Fishbase的資料是可以參考的，只是就像你說的，會有出現一般人不知道俗名，
而這個俗名只有學術圈的人才知道你在說什麼。
台灣魚類資料庫的部份，本來就不是以觀賞魚為主，加上經費上的一些問題(之前)。
我想你真的有興趣做的話，建議你近期趕快去找中研院的 邵廣昭老師，
只是他不知道退休了沒，因為有說要退休一點時間了。
至於可以怎樣整合就看怎麼談了。
Fishbase的部份，大多數人其實都不知道，會知道這個的...又是學術圈的人居多。
問題還是中文的俗名(其他太深的問題就都跳過吧)
用你舉例的，斑馬魚 至少需要讓一般民眾可以知道這是斑馬魚，
這時候就希望乾脆都用英文算了，什麼問題都解決了。
QR code的問題是如何讓業者願意用而已，畢竟三不五時就要更新(不同的魚一直進)。
但是就像是你說的，可以從出現最平凡的魚種做起。
不知道你有沒有一本觀賞魚的書，熱帶魚 水草2700種圖鑑。
如果沒有的話，我覺得你可以收藏一本，裡面可以解決不少問題。
再來就去逛逛水族館，如果可以，也建議你台北，台中，高雄，彰化的水族館都去走走
你會發現一些共通點和差別(廢話)，這我不知道怎麼解釋，但就市場調查吧。
進口商 業者 當地出口商這些問題，其實就先跳過吧
畢竟有太多的魚種命名上是有困難的，你如果是做分類的就會明白了。
而北大的教學那個，我覺得也可以先跳過。
你想要的是先從0分到60分，而不是80分到90分。
要掌握的是多數一般對魚沒有什麼太多概念的普通民眾為主。
稀有魚就都跳過~~跳光光!!! 這些都是養到一個階段的人都會知道怎麼去找。
另外市面上確實有機會有些很常見到的魚卻沒有學名，但這是少數，就也先跳過吧。
萬事起頭難，不過你可以參考看看。
P.S. 日本有做 淡水魚 海水魚圖鑑的APP，至於後續我就不知道了
以上是我想到的，剩下的就靠你去執行了XD。
※ 引述《toploader (略)》之銘言：
: 1.架站
: 2.學名
: 這兩個問題目前有想到三個方法分別繞過去，不過都有一些不確定性。
: [架站]
: 不曉得去水族館的消費者對fishbase的接受比例有多高？
: Danio rerio在fishbase的檔案頁「網址」長這樣：
: http://fishbase.sinica.edu.tw/summary/Danio-rerio.html
: 看起來幾乎是將學名嵌在網址裡面。
: 如果去水族館的消費者對fishbase的接受度夠高，
: 那麼對於已經有用試算表做庫存清單的店家來說，
: 如果能在庫存清單加上一欄學名，用Excel的CONCATENATE函數，
: 連接字串就可以在另一欄組合出該魚種在fishbase的網址，
: 接著用批次產生QR Code就可以得出所有QR Code了
: （請Google「批次 QR」關鍵字）。
: 如果fishbase被消費者接受的比例夠高，這個方法目前應該已經可以直接用，
: 也不複雜，熟悉之後操作時間很短，
: 不過就是不確定不同水族館的客群對fishbase的接受比例如何。
: 如果不能確定另外建立資料庫的收益大於投入，沒有可能架站，
: 也只能使用現有的資料庫來繞過這個問題。
: 可惜魚類資料庫好像都不會直接列是否適合混養之類的資訊。
: [學名]
: 進口商不會提供正確的學名，若業者也不熟悉學名、生物分類的知識，
: 確實沒有可能知道自己賣的活體是什麼學名，
: 有心也不可能用資料庫做什麼QR Code。
: 尤其是在看到北大這篇文章：「帝王燈、國王燈，一堆王者怎麼分？」
: http://northernstar-aquarium.blogspot.tw/2012/06/blog-post_25.html
: 發現原來有「已經在市面上流通，卻還沒有正式學名」的例子時，
: 我想以學名為主的魚種資料庫也許已經沒有可能涵蓋所有水族館會賣的觀賞魚了～
: 但文末提到沒有正式學名的帝王藍燈，市面很少看到，
: 我好奇：以目前一般水族館常見魚種而言，是否還有這種沒有正式學名的例子？
: 如果市面上算常見的魚種都已經有正式學名，
: 那麼這些已經很常見的魚種應該都會有台灣通用俗名（有不只一個俗名也沒關係），
: 如果可以用俗名來查魚種資料庫呢？
: 那業者不知道學名也沒關係，只要能認出哪種常見俗名是哪種魚，
: 然後資料庫的常見俗名足夠完整就可以。
: 確實沒辦法用資料庫來查所有的觀賞魚種，
: 但以資料庫的用途是用來讓消費者比較不會買到不適合自己的魚，
: 或是簡化那些本來就會習慣先查資料的消費者們查資料的流程來講，
: 會對稀有高價魚種有興趣的應該都是老手？
: 或者說起碼在買之前會企圖多跟專業的老闆聊一聊？
: 我自己會覺得若水族館會應用魚種資料庫做QR Code，
: 減少不專業店員顧店帶來的風險，減少顧客買錯魚而養死魚的挫折，
: 來改善顧客的消費體驗，
: 資料庫的目標對象可能優先涵蓋新手比較會買的常見魚種即可，
: 稀有高價魚的展示缸就不用放QR Code了，
: 因為老手有耐心自己查，比較不會出現這種錯誤（？）
: 用俗名來查魚種資料庫也有目前還不曉得能否解決的問題：
: 以台灣魚種資料庫來看，拉漢魚典的俗名欄位似乎都是空白，
: 就算將同網站下「農委會同意輸入野生水產物種名錄」的俗名資料複製過去，
: 比方說紅鼻剪刀、皇冠豹、電光斑馬，
: 也還有缺一些常見魚種的常見俗名，比方說紅蓮燈、紅燈管、日光燈。
: 台灣魚類資料庫如果在這一段能有一個「方便水族愛好者提出俗名增修建議的方式」，
: 也許可以很好解決這個問題。
: 但這個作法可行性怎麼樣，目前還是不確定的～
: 你在fishbase首頁的俗名（Common Name）區塊，直接按下方的「中文」這張圖片，
: 會發現fishbase也是有俗名，
: 只是不曉得為什麼我輸入關鍵字要搜尋俗名都沒有作用啊！
: Panaque nigrolineatus的俗名也是寫「黑線巴拉圭鯰」，
: 看了不知道是什麼的名稱。
: 要怎麼建議fishbase修改，我就更沒有頭緒了。
: 繞開學名的第二種方法，是之前提過的自動辨識技術，
: 不過期待這個大概會更不靠譜XD
: 以上是目前想到的，也謝謝你指出問題。
: ※ 引述《alvinyan (繁殖鼠魚100種)》之銘言：
: : 先不提其他魚的相關問題，因為太多了。
: : 就最簡單的資料庫，架站的費用是要代管，還是自己架，後續誰維護呢?
: : 這個問題就有點麻煩了。
: : 當然也可以用最簡單的方式用台PC架站，但還是需要有人做後續的定期維護。
: : 台灣魚類資料庫用的是中研院的資源，自然歡樂許多，畢竟有參與過。
: : 賣照片很值錢呢...離題了。
: : 資料庫的建立，軟硬體的費用其實開銷也不少，透過學術單位建立的好處是省很多錢。
: : 商業模式的話，就需要有廣告或是有人佛心建立(像是經營論壇)。
: : 問題還是卡在錢XD...
: : 學名是很好的方式，但是...學名往往也很多悲劇
: : 進口報單上最容易出現只有屬名+sp或是 屬名+形容詞(無圖)，根本就是福袋阿...
: : 就只能期待那些比較特別的水族館會告訴你學名或是自己google了...
: : 另外中文名字還有會有兩個問題，水族館的俗名和學術名?。
: : 舉例：鼠魚 VS 兵鯰
: : 客人：老闆，請問你們有沒有賣鼠魚?
: : 老闆：有阿，你要琵琶鼠還是黃金青苔鼠? (客人已哭)
: : 客人：老闆，請問你們有沒有賣兵鯰?
: : 老闆：沒有喔，不好意思。或是 那個叫做鼠魚啦，不叫做什麼兵鯰。
: : 畢竟水族在商業上還是算小眾市場，但是每年水展都會告訴你水族有多少億商機呢!
: : 我老學校比較喜歡書...
: 我可以理解喜歡實體書的心情～
: : 嘴完了XD