直接出新一代，
主角遇到某壯漢NPC，
問要吃藍色還紅色藥丸，
隨便哪個都沒差反正都是要進主線故事，
會跑到一個叫做母體的地方，
然後開始收服寶可夢打敗最後大魔王死秘濕，
結果故事沒有結束....
母體之主肯得基先生出現在玩家面前，
語重心長的告訴玩家說其實在幾百年前就發生過寶可夢大戰，
母體傷勢過重所以記憶體受損，
直接導致了大約500種的寶可夢資料被滅亡刪除，
剩餘的寶可夢數量已經是記憶體的上限了，
肯得基先生請求跟主角和解別再戰了，
玩家畫面上出個兩個選項，
選項： 和解 / 之後和解
之後故事完結。