個人經驗分享
在此也感謝歐旅版的眾多前輩提供的寶貴資訊
今年二月也是想買布達佩斯到布拉格這段的夜車臥舖
跟原po一樣
從匈牙利、捷克跟德國鐵路的官網都沒辦法買
匈牙利是只有座位
捷克是只能買捷克出發（？）
德國是只能看到這段但沒辦法買
......後來想想，那如果我把終點設定到德國境內呢？
於是就試著在德鐵上把行程設成「布達佩斯到德勒斯登」
（德勒斯登離布拉格單程約2小時）
當時想說沒辦法早下車的話
就先去玩德勒斯登半天再搭車回布拉格好了
結果......噹噹！
從德鐵網站上這樣的行程就可以買臥舖了！
（價格好像一樣，不太確定）
不過...沒辦法網路列印
必須要用郵寄的方式，多3.9歐的郵資
大概三個禮拜收到
（我買的時候碰到聖誕假期，所以慢了點
上網查德鐵的郵寄時間正常約8-12個工作天）
到了現場之後
提示車票後上車，並跟服務人員表示要在布拉格下車
（布拉格沒記錯的話有兩個停靠站，請再確認自己的下車地點）
服務人員表示沒有問題
將車票上記載的終點當場改成布拉格
就順利的在布拉格下車了
（至於該服務人員指著我們的護照，並堅持說
「我們是中國人」、「台灣是中國的一部份」，完全不聽我們解釋
氣到我跟太太第一次輪流在外國用英文跟人吵架
這就是另一個故事了......）
總之
上述方式供參考