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以下依A~L組排列（以及歐冠聯小組第三成績排序）
小組第一晉級 + 歐冠聯小組賽成績最佳的四個小組第三：
DEU Bayer 04 Leverkusen
AUT Red Bull Salzburg
RUS FC Zenit St Petersburg
CRO GNK Dinamo Zagrab
ENG Arsenal
ESP Real Betis
ESP Villarreal CF
DEU Eintracht Frankfurt
BEL KRC Genk
ESP Sevilla FC
UKR FC Dynamo Kyiv
ENG Chelsea
ITA SSC Napoli
ESP Valencia CF
ITA Inter Milan
POR SL Benfica
小組第二晉級 + 歐冠聯剩餘的四個小組第三：
SUI FC Zuerich
SCO Glasgow Celtic
CZE SK Slavia Praha
TUR Fenerbahce SK
POR Sporting Lisboa
GRE Olympiacos FC
AUT SK Rapid Vienna
ITA SS Lazio
SWE Malmo FF
RUS FC Krasnodar
FRA Stade Rennais FC
BLR FC BATE Borisov
CZE FC Viktoria Plzen
BEL Club Brugge KV
UKR FC Shakhtar Donetsk
TUR Galatasaray SK