萬華那波疫情我很有印象
4/20的時候，兩位從美國飛回來的機師(案1078, 1079)驗出病毒陽性。
而在同一天，澳洲也通知有一名台灣的機師驗出病毒。
之後新北、宜蘭，之後全台各地開始出現案例。
扣除掉這三個案例，
最早的案例就是在台北市發現的，所以台北市會是破口嗎?
以現代流行病學來說，
發現案例的城市不一定就是病毒的起源地。
這邊首先要釐清幾個問題，
1. 各個群聚案是不是來自同一個起源?
2. 如果是，那麼起源的時間與地點是哪裡?
要回答這些問題就需要從病毒序列來看
當時CDC公布只說spike序列是一致的
這段序列因為變異性很高，因此可以拿來朔源。
不過對病毒有些了解的人會說這段序列只佔全長的約1/10左右，
有可能剛好在spike上一樣而已。
然而事實是，
從全基因組來看，
全部的傳染鏈都是同一個起源，
而且這個病毒序列的特徵只在台灣有。
簡單來說，
引發這波疫情的病毒起源不像有些人說的那樣是從美國帶回來的，
而是在台灣產生的。
而且有趣的是，
被認為是最早案例的1078, 1079，
從他們的序列可以推斷，
他們甚至也不是最早的案例了。
這一波疫情如果做最早共祖分析，
得出的結果是這波疫情的源頭
早在3月中旬就已經產生。
這其實跟事實也吻合，
因為1078及1079根據Ct值，
就已經發現是在不同的感染階段了。
(而且前面也說他們不是最原始的病毒序列了)
而且機師跟家屬在檢驗的時候，
有不少顯示陰性，但血清檢驗顯示他們早就感染過病毒了。
(當時台灣清零一陣子了，不應該感染過。)
這些感染者唯一重疊的足跡，
就是都在桃園的防疫旅館隔離過，
加上早在3月源頭病毒就已經產生，
可以合理推測病毒源頭應該就是潛藏在這裡。
如果真的要說為什麼會爆發疫情的話，
我個人的立場是認為防疫旅館的管理有改善空間。
可以說是，
如果病毒管理得當，
病毒根本不應該離開桃園，更不會擴散到台北新北以及全台各地。
至於跟3+11(4月14日)有沒有關聯，
這點不是我的專業，我也沒有任何科學依據。
不過我個人的想法是，
改成3+11遲早爆開，
但第三波疫情我自己覺得是在3+11之前已經悄悄蔓延了。