個人經驗談，我去過的日本各地幾乎都會去2次，基本上我都採取：
1.第一次跟團
2.第二次自助
跟團和自助優缺點這邊就不分析了，第一次跟團原因在於享受一切
都不需要自己來的悠閒，遊覽車停車就開始逛。個人認為跟團最大好處
是交通優勢，也因為交通優勢所以能看的點比較多（排除自助那種趕行程安排）
當看的點比較多了，第二次我就會選擇自助，從上一次跟團中景點
選擇自己想去的（古蹟大自然），排除那種雞肋的（購物），
增加那種較少台灣人去的（中部山岳阿爾卑斯）。可以更深入、
更自由的安排時間地點。
我本身的喜好是攝影，舉跟團兩個例子：
有一次我跟的是關西團，某天早上有兩個點，第二個點是平安神宮，
去過都知道平安神宮廣場大的很，不巧因為是第二個點，抵達時間是
11點左右，這時間太陽之毒辣、光線高反差...拍照也不是參觀旅遊也不是。
還有一次是早上6點導遊就把我們挖起來，驅車前往上高地地區，
一路上幹的要死呵欠連連，但一抵達...依然是幹的要死，但幹的是
導遊你怎麼不5點就把我挖起來，這地方這時間光線實在是太讚了。
但最後依然還是幹的要死，因為大正池 - 河童橋導遊只給我們2個小時。
由以上個人經驗（當然還有其他很多）...我知道某些點適合某些時間去，
以我個人而言，跟團是為了下次自助的提前場勘，真正的目的是自助。
當然也要看地點，像歐美許多地方，我預定這輩子大概只會去一次。
如法國...算了我完全不懂法文（傳說法國人有法文優越感） → 跟團
如德國...喔我實在是太喜歡國王湖了（想在這邊停留將近一天）→ 自助
上面例子完全偏向自由心證及各人喜好，個人有各人看法，總結一下我個人
大概就是以下面幾個觀點取決跟團還是自助：
勇氣 > 國家（含交通治安衛生等） > 預算 > 是否再次前往
給你當參考