Re: [問題] 新手問題(已爬文)

作者: xac420 (這是藉口你應該懂吧)   2014-05-29 10:29:24
我已經有在資料夾裡建立一個Theorem.R
然後用了以下這個
#!/bin/sh
#PBS -l walltime=9999:00:00
cd $PBS_O_WORKDIR
/opt/R-2.15.2/bin/R CMD BATCH Theorem.R
這時資料夾跑出一個Theorem.Rout
然後我又輸入
qsub -l nodes=nodexx Theorem.sh
但他就跟我說
qsub: script file:: No such file or directory
接著我又試
qsub -l nodes=1 Theorem.sh
還是
qsub: script file:: No such file or directory
我完全不知道是該怎麼做...可以請前輩救救我嗎... T_T
感激不盡!!!
※ 引述《xac420 (Up to fate!)》之銘言:
: 各位前輩 老妹臨時被老闆要求使用cluster跑程式
: 我看網頁弄了半天就是不會存shell file...
: 檔案夾裏有.R 因為我要跑R 可是我不知道怎麼存.sh
: 完全沒有頭緒啊啊啊啊...希望有人可以教我一下>"<
: 謝謝!!!
作者: xac420 (這是藉口你應該懂吧)   2014-05-29 10:30:00
對了 我是用putty執行
作者: cocobox (錢盒子)   2014-05-29 10:52:00
qsub -l nodes=1 Theorem.R 這樣?
作者: xac420 (這是藉口你應該懂吧)   2014-05-29 11:01:00
剛剛有試了 還是跟我說No such file or directory到底是怎麼回事啊.....>"<
作者: jokester (蠻王科科)   2014-05-29 11:03:00
找附近的好人吧
作者: obarisk (OSWALT)   2014-05-29 11:04:00
qsub -l nodes=1 bash xxx.sh和qsub不熟chmod +x xxx.shqsub -l nodes=1 ./xxx.sh
作者: xac420 (這是藉口你應該懂吧)   2014-05-29 11:15:00
obarisk同學 我剛剛用qsub -l nodes=1 bash xxx.sh 然後跑出一堆東西..但我還是不知道我做對做錯...要死了!!
作者: wyvernlee (wyvernlee)   2014-05-29 20:40:00
原 po 最近真忙,一下子問 LaTeX,一下子問 Linux ..有沒有考慮換個領域比較相近的老闆比較好過 ? XD
作者: mike7689 (帥啊~!老皮~!!)   2014-05-29 20:42:00
如果你在北部可以找我,我大概知道你的問題但懶得線上解迷我在119...如果你靠近木柵附近更好XDps. 我是作計算物理的,目前用latex寫碩論
作者: suzuke (suzuke)   2014-05-30 00:17:00
qsub是個排程工具, 你要不要先去翻一翻文件?簡單來說qsub xxx.sh是要將xxx.sh這支script(程式)送給qsub來排程, 等到有空的node就會在那個node上執行xxx.sh裡面的指令, qsub還有一堆參數可以下, 這就要去翻文件了我已經畢業有一陣子了, 所以記憶不太清楚, 參數的部份我無法幫你QQ
作者: xac420 (這是藉口你應該懂吧)   2014-05-30 09:43:00
wyvernlee 哀呀被你發現!可是我很喜歡我老闆誒XD 不想換~mike7689 請問119是?消防隊?我在台北..私下找你謝謝!suzuke 對!!我就是要等node幫我執行我存的.sh
作者: soem (流水)   2014-05-31 12:54:00
應該是指140.119的樣子

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