大家好
我希望執行 Samtools 軟體的 tabix 功能之後,能在輸出的檔名中放入變數
使用的指令如下:
Usage: tabix [FILE] [REGION] > [OUTPUT_FILE]
for i in {1..9}
do
echo "tabix A.sam.gz chr0$i > A$is.sam.gz"
done
但 echo 的輸出檔名在 $ 之後就不見了
tabix 42467unmapped_to_NPBs.sam.gz chr01 > 42467unmapped_to_NPB.sam.gz
tabix 42467unmapped_to_NPBs.sam.gz chr02 > 42467unmapped_to_NPB.sam.gz
......
Google 了一下可能關鍵字錯誤找不到修正的方法
麻煩大家指點一下方向,謝謝!!!