我自己沒有這個問題，但是網路上有其他人的解法：
1. 開finder, 前往資料夾「~/library/Preferences」
2. 刪除「loginwindow.plist」
和「com.apple.loginitems.plist」
3. 再去 System Preferences > System > Accounts > Login Items
現在應該是空白的，把程式一個一個加回去
（可以先加一個或兩個，確定可行之後再全部放回去，不然還是失敗你會崩潰）
4. 登出再登入，照理說就可以了
來源：http://i.imgur.com/TGD8mXy.png
※ 引述《GUNDAMGOGOGO (B!kada )》之銘言：
: 使用者與群組>登入項目>登入時會自動打開的項目
: 本來更新玩10.9.5後一直都蠻正常的
: 但是今天早上開機的時候又消失了
: 雖然不是很多項，一個一個家回去就好
: 可是總會覺得很麻煩...
: 上網跟爬文也找不到解決方案
: 請問有人面臨同樣狀況已經解決的嗎？
: 謝謝