Hi學弟你好，我是北科材料系畢業的。
基本上機械系的課程比材料系重視數學，各種力學會需要各種數學工具。
材料系則重視化學及微觀結構(奈米科學)。
由於現在的半導體的尺度都在奈米級了，因此材料系的畢業生很多去了半導體業。
機械系是工業之母，自然就業的廣度比材料系高。
我自己是材料學碩，對各種化學實驗以及材料檢測有些了解，畢業後去雷射廠做雷射加工應用，學了一些光學，CAD和CNC G-code，後來跳到半導體業，學到了用matlab做數據處理，專案管理還有風險管理(比較方法論的東西了，但是很實用)。
由於我的經歷算是兩個科系的專業都有涉略，各自的專長我算是很了解。
機械系擅長模擬(熱，力，電等)以及制造，設計。我很佩服我的機械同事們模擬的能力，我也也從他們身上學到很多GD&T的知識。
相對的，我們材料系專業的對各種檢測方式，如電子顯微鏡及各種光譜學都算熟悉。
孰高孰低我就不多加評論了，我畢竟沒在台灣工作過。我覺得最重要的是能持續去學習新的知識和能力，尤其現在常常需要的是跨領域的職能。有機會的話，可以出國念個碩博(看你ID好像有美國身份？)，美國的產業對這兩個系的需求感覺是又比台灣更廣了。