[問題] 讀取巨大影像問題(33GB的圖像) Oranga PTT批踢踢實業坊

[問題] 讀取巨大影像問題(33GB的圖像)

作者: Oranga (橘阿) 2018-03-31 18:23:38

大家好
小弟最近在處理一個醫學的影像，是.mrxs的whole slide image。
就我現在所知，這類型影像的主要開啟軟體為Case Viewer，
但裡頭似乎並沒有切割影像的處理功能。
以致於小弟必須整張slide輸出轉檔成Tiff，礙於解析度不能掉，
整張圖片大小高達33GB... 詳細資訊如下

作者: goldflower (金色小黃花) 2018-03-31 20:37:00

https://i.imgur.com/48CQ7E7.png 這樣應該可切.load()不會讀全部檔案有點像(但不是)cursor吧我後面reshape那邊在耍白痴... 反正就中間for在切

作者: ThxThx (洗洗睡) 2018-03-31 20:39:00

樓上這樣要把圖片全部load進memory...我推薦LargeTIFFTools喔喔不會是嗎！？

作者: goldflower (金色小黃花) 2018-03-31 20:51:00

.load()是根據給的i,j去讀pixel 不會全抓不過我只有試切一張幾百MB的tif而已@@

作者: Oranga (橘阿) 2018-03-31 22:13:00

!! 感謝gold大大跟Thx大大我這就來試~ 晚點稟報結果~

作者: goldflower (金色小黃花) 2018-04-02 13:44:00

好奇所以後來行不行R?

作者: Oranga (橘阿) 2018-04-04 17:34:00

抱歉~ 後來有其他模組上的問題所以拖了很久他還是會整張讀取所以沒辦法><

繼續閱讀

[問題] SSL for Django + Nginx + uWSGIarchon [推荐] 雙北國民運動中心/即時人流Appspeedkevin Re: [問題] 讀取資料問題AlaRduTP [問題] 讀取資料問題MAGICXX [問題] 迴圈串列問題thethirdfoot Re: [問題] 資料分析相關書籍Marsden [問題] 資料分析相關書籍k5209630 [問題] Python執行pydotplus出現錯誤?killer01 [問題] Python 執行flask hello word出現錯誤Archi821 如何取值 restfultree581