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問題
[問題類型]:程式諮詢
意見調查(我對R 有個很棒的想法,想問問大家的意見)
程式諮詢(我想用R 做某件事情,但是我不知道要怎麼用R 寫出來)
效能諮詢(我想讓R 跑更快)
經驗諮詢(我想用R 連接某些資料庫,請問大家的經驗)
程式諮詢
[軟體熟悉度]:入門
請把以下不需要的部份刪除
新手(沒寫過程式,R 是我的第一次)
入門(寫過其他程式,只是對語法不熟悉)
使用者(已經有用R 做過不少作品)
開發者(有撰寫R 的套件經驗)新手
[問題敘述]:由於不是很懂R,麻煩懂的人幫我解釋一下最下面那段程式碼(每一行的設計意義),晶片的位置在這邊下載(http://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/files/E-MEXP-569/E-MEXP-569.raw.1.zip)
請簡略描述你所要做的事情,或是這個程式的目的
[程式範例]:source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("affy")
biocLite("GeneNet")
biocLite("limma")
biocLite("tkWidgets")
biocLite("Biobase")
biocLite("AffyID2GeneID")
source("http://faculty.ucr.edu/~tgirke/Documents/R_BioCond/My_R_Scripts/GOHyperGAll.txt")
AffyID2GeneID(map =
"ftp://ftp.arabidopsis.org/home/tair/Microarrays/Affymetrix/affy_ATH1_array_elements-2010-12-20.txt")
library(affy)
library(limma)
library(tkWidgets)
library(annaffy)
library(GeneNet)
作者: yanchenglin (LIN) 2014-05-17 17:32:00
ggm.estimate.pcor network.test.edges extract.network 看這3個函數的help. 其他應該還好懂