Re: [問題] 想利用data.table將Rawdata切割欄位

作者: celestialgod (天)   2015-02-23 21:05:43
> [問題敘述]:
> 各位前輩們好,
> 小弟有一筆資料大約為500MB左右,
> 因這筆資料為原始檔案,
> 還沒將欄位定義好,
> 所以小弟想詢問如何讀入data.table後,
> 在將欄位進行切割?
>>
> example:
> var1
> 1 001female 2019920404
> 2 002male 3019920505
> 3 003male 4019920606
> 4 004female 5019920707
>>
> 希望可以透過欄位切割後變成:
> id sex income birthday
> 1 001 female 20 19920404
> 2 002 male 30 19920505
> 3 003 male 40 19920606
> 4 004 female 50 19920707
手癢寫了一下@@
code:
library(data.table)
library(magrittr)
dat = fread("001female2019920404\n002male 3019920505\n003male
4019920606\n004female5019920707\n", sep="\n", sep2="", header=FALSE)
library(Rcpp)
library(inline)
sourceCpp(code = '
#include <Rcpp.h>
using namespace Rcpp;
// [[Rcpp::export]]
List dat_split_f( std::vector< std::string > strings, NumericVector loc) {
int loc_len = loc.size(), num_strings = strings.size();
List output(num_strings);
for( int j=0; j < num_strings; j++ )
{
std::vector< std::string > tmp;
for (int i=0; i < loc_len-1; i++)
tmp.push_back( strings[j].substr(loc[i], loc[i+1] - loc[i]) );
output[j] = tmp;
}
return output;
}')
# 第二個input 第一個固定是0 第二個是第一個字串結束位置
# 第三個是第二個字串結束位置,依此類推,有k個column放k+1個值
# 這個可以用手算,也可以用regular expression去找對應位置,自行定奪
# 補充: 用C++邏輯想是,前k個是每個字串開始位置,最後一個是總長度
dat_split = dat_split_f(dat[[1]], c(0, 3, 9, 11, 19)) %>%
do.call("rbind", .) %>% data.table()
# 之後自行再把需要轉成數字的chr轉成numeric就好
測試一下40萬個row
dat = fread(paste0(rep("001female2019920404\n002male 3019920505\n003male
4019920606\n004female5019920707\n", 100000), collapse=""),
sep="\n", sep2="", header=FALSE)
tt = proc.time()
dat_split = dat_split_f(dat[[1]], c(0, 3, 9, 11, 19)) %>%
do.call("rbind", .) %>% data.table()
proc.time() - tt
# user system elapsed
# 3.34 0.01 3.50
四百萬個ROW大概是67秒
CPU: Intel Celeron B830@1.80G in windows 7 64bit with R 3.1.2
還要更快可以找我的文章(R_Language #1JiQHkrP),在Rcpp中加入openmp加速
Reference: http://gallery.rcpp.org/articles/strings_with_rcpp/
作者: cywhale (cywhale)   2015-02-23 22:33:00
推~晚點來試看看
作者: squallscer (羽毛)   2015-02-23 22:38:00
非常感謝!我會在試試看!!
作者: andrew43 (討厭有好心推文後刪文者)   2015-02-24 20:01:00
c版友,下次您貼這種優質好文的時候別把原文刪了啦,這樣收精華區以及別人查閱都會比較方便。幹嘛道歉啦 XD
作者: squallscer (羽毛)   2015-02-24 20:23:00
推c大熱心且優質文章! 第一次使用rcpp,我會先看相關
作者: andrew43 (討厭有好心推文後刪文者)   2015-02-24 20:26:00
耶,謝謝你貼原文回來!
作者: celestialgod (天)   2015-03-01 12:08:00
後來發現str_sub {stringr}比substr快不少

Links booklink

Contact Us: admin [ a t ] ucptt.com