[問題] R segment fault on linux Centos7

作者: likuyun (吃吃吃..只會吃)   2017-06-29 21:39:58
[問題類型]:
程式諮詢
[軟體熟悉度]:
使用者(已經有用R 做過不少作品)
[問題敘述]:
我在linux Centos7.3的環境下使用linux本機端的R-3.4.0,結果出現segment fault(core dump)
但使用同一台linux的RStudio server IDE執行相同code,可正常執行.
確認linux本機端開啟的R與RStudio server開啟的都是/srv/lib64/R/bin/R <
作者: celestialgod (天)   2017-06-29 22:01:00
你是用crontab?crontab通常環境變數都不夠,要設定像是我都要給JAVA路徑在PATH中、給JAVA_HOME給Oracle的so檔案 (for ROracle)等
作者: likuyun (吃吃吃..只會吃)   2017-06-29 22:03:00
是的 我是用crontab
作者: celestialgod (天)   2017-06-29 22:04:00
so檔案的連結是放在 LD_LIBRARY_PATH裡面
作者: likuyun (吃吃吃..只會吃)   2017-06-29 22:05:00
明天試看看 環境變數PATH中 加入 JDBC的資料夾絕對路徑
作者: celestialgod (天)   2017-06-29 22:05:00
JAVA是放$JAVA_HOME/jre/lib/amd64/serverPATH中放入上述的位置反正先用library(rJava)測試crontab是否可以正常然後測試.jinit是否可以正確吃到jar檔案最後才去試RJDBC不過我JDBC連法跟你不同@@我是用.jinit 參數classpath放需要的jar檔案然後直接開JDBC另外因為Java容易GC overhead,還有放-Xmx8g的參數
作者: likuyun (吃吃吃..只會吃)   2017-06-29 22:11:00
-Xmx8g 我都用到32G 但這次問題我搞好久搞不定
作者: celestialgod (天)   2017-06-29 22:13:00
反正你照我的測試方法走一次看看,不行再來找問題QQ

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