[問題] Rmpi 安裝請教 boshings PTT批踢踢實業坊

[問題] Rmpi 安裝請教

作者: boshings (bo) 2019-05-07 22:55:47

[問題類型]:
程式諮詢
[軟體熟悉度]:
入門
[問題描述]:
我想在用國網中心HPC主機執行平行運算，Rmpi一直無法安裝成功。
嘗試了幾個環境模組仍然失敗。
1) gcc/6.3.0 2) intel/2018_u1 3)openmpi/gcc/64/1.10.3
[程式範例]:
> install.packages("Rmpi")
Installing package into ‘
/home/u1/ee/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.5’
(as ‘lib’ is unspecified)

作者: Wush978 (拒看低質媒體) 2019-05-07 23:09:00

安裝 openmpi-devel

作者: celestialgod (å¤©) 2019-05-09 00:00:00

我用mpich2 安裝成功，openmpi沒成功過安裝的時候記得要指定mpi type網路上google找的到相關教學(系統是用centos 7)PS: 用wget先抓下套件tar.gz 再用R CMD INSTALL我好像沒用內建的install.packages成功過...

作者: clickhere (It's time to go home.) 2019-05-09 10:51:00

找出 mpi.h 和 libmpi.so 的 path用 R CMD INSTALL Rmpi*.tar.g --configure-args="--with-Rmpi-include=...path.to.mpi.h--with-Rmpi-libpath=...path.to.libmpi.so"Rmpi 裡的 README 寫得很清楚

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