以下列車行駛日期均為108年1月1日1天，車種均為EMU。
順行
區間車 3106次 嘉義→斗六
嘉 義 嘉 北 民 雄 大 林 石 龜 斗 南 斗 六
01:20 01:24 01:30 01:36 01:40 01:45 01:51
區間車 3806次 沙崙→臺南
沙 崙 長榮大 中 洲 仁 德 保 安 臺 南
00:25 00:30 00:36 00:39 00:42 00:49
區間車 3812次 沙崙→臺南
沙 崙 長榮大 中 洲 仁 德 保 安 臺 南
00:42 00:48 00:54 00:57 01:00 01:07
區間車 3818次 沙崙→嘉義
沙 崙 長榮大 中 洲 仁 德 保 安 臺 南 大 橋 永 康 新 市 南 科 善 化
01:05 01:11 01:17 01:20 01:23 01:31 01:35 01:39 01:45 01:50 01:54
拔 林 隆 田 林鳳營 柳 營 新 營 後 壁 南 靖 水 上 嘉 義
01:59 02:02 02:07 02:11 02:15 02:22 02:27 02:30 02:37
區間車 3824次 沙崙→嘉義
沙 崙 長榮大 中 洲 仁 德 保 安 臺 南 大 橋 永 康 新 市 南 科 善 化
01:42 01:48 01:54 01:57 02:00 02:08 02:12 02:16 02:22 02:27 02:31
拔 林 隆 田 林鳳營 柳 營 新 營 後 壁 南 靖 水 上 嘉 義
02:35 02:39 02:44 02:48 02:52 02:58 03:04 03:07 03:13
區間車 3276次 高雄→臺南
高 雄 三塊厝 鼓 山 美術館 內 惟 左 營 新左營 楠 梓 橋 頭 岡 山 路 竹
01:12 01:14 01:17 01:20 01:22 01:24 01:28 01:34 01:38 01:43 01:49
大 湖 中 洲 仁 德 保 安 臺 南
01:53 01:58 02:01 02:04 02:11
區間車 3830次 沙崙→嘉義
沙 崙 長榮大 中 洲 仁 德 保 安 臺 南 大 橋 永 康 新 市 南 科 善 化
01:50 01:56 02:02 02:05 02:08 02:16 02:20 02:24 02:30 02:35 02:39
拔 林 隆 田 林鳳營 柳 營 新 營 後 壁 南 靖 水 上 嘉 義
02:44 02:47 02:52 02:56 03:00 03:07 03:12 03:15 03:22
區間車 3286次 高雄→嘉義
高 雄 三塊厝 鼓 山 美術館 內 惟 左 營 新左營 楠 梓 橋 頭 岡 山 路 竹
01:40 01:43 01:46 01:49 01:51 01:54 01:58 02:03 02:07 02:12 02:18
大 湖 中 洲 仁 德 保 安 臺 南 大 橋 永 康 新 市 南 科 善 化 拔 林
02:22 02:26 02:30 02:33 02:41 02:44 02:48 02:54 02:59 03:03 03:08
隆 田 林鳳營 柳 營 新 營 後 壁 南 靖 水 上 嘉 義
03:11 03:16 03:20 03:24 03:31 03:36 03:39 03:46
逆行
區間車 3309次 新左營→潮州
新左營 左 營 內 惟 美術館 鼓 山 三塊厝 高 雄 民 族 科工館 正 義 鳳 山
01:18 01:21 01:24 01:27 01:29 01:32 01:36 01:40 01:42 01:45 01:48
後 庄 九曲堂 六塊厝 屏 東 歸 來 麟 洛 西 勢 竹 田 潮 州
01:51 01:56 02:01 02:05 02:08 02:11 02:14 02:18 02:23
區間車 3279次 臺南→高雄
臺 南 保 安 仁 德 中 洲 大 湖 路 竹 岡 山 橋 頭 楠 梓 新左營 左 營
01:33 01:40 01:42 01:47 01:52 01:56 02:04 02:08 02:13 02:20 02:24
內 惟 美術館 鼓 山 三塊厝 高 雄
02:26 02:29 02:32 02:36 02:38
區間車 3109次 嘉義→臺南
嘉 義 水 上 南 靖 後 壁 新 營 柳 營 林鳳營 隆 田 拔 林 善 化 南 科
01:19 01:25 01:28 01:34 01:41 01:44 01:49 01:55 01:59 02:04 02:08
新 市 永 康 大 橋 臺 南
02:13 02:18 02:22 02:26