地下化最大的問題是什麼？答案是交通黑暗期和挖到古蹟停工。
交通黑暗期的問題就是商圈大幅衰退（參照海安路）
像民生路、公園路這些繁榮商圈都會先沒落個7年左右，
等到通車後才會開始回復。
還有，單軌要在哪裡鑽入地下？哪裡出土？出土跟下地段勢必要要拓寬道路，
到時一堆低能左膠又出來鬧，是要重演鐵路地下化的戲碼嗎？
那後者呢？舉京都來說好了：
京都市營地下鐵雖然只有兩條路線，但是在當初建設時，
經常挖到古蹟導致工期嚴重延宕，
2015年度營業利益(含補助)8億日幣
但是尚有3911億日幣的債務未償還。
羅馬地鐵也是因為地下埋藏有大量古羅馬文物，至今仍然只有３條路線。
每公里的造價也遠較歐洲其他都會來的高。
至於有說要輕軌的，依照台南舊城區的路面蓋輕軌絕對會塞死，
高架輕軌所要路幅也會比單軌來的大些。