<背景>
宇宙歷2000年，在銀河系，議會中来自眾多星球的代表，共同成立「銀河聯邦」。自此迎
接著繁榮的時代。文明和文化的交流繁盛地進行，大量的星間聯運船彼此往返著,不過，
另一方面襲擊船艦的宇宙海盜也開始出現了。
雖然聯邦局組織了銀河聯邦警察，然而在在廣大的宇宙中海盜強而有力攻擊困難。在那
裡聚集使追捕行動變得格為困難，因此除了在聯邦局的聯邦警察外，另外有勇猛果斷的戰
士們聚集與海盜們作戰。他們被稱為宇宙戰士，藉由抓住海盜收受賞金來賺錢。
宇宙歷20×5年，發生了重大的事件。外宇宙調查船遭受宇宙海盜襲擊，被奪去了被稱為
「行星SR388」的一種未知的生命體的膠囊。此生命體是一種浮游生命體，如果24小時照
射β射線重新開始活動增殖。
而且SR388星的文明，懷疑不知受到何人的破壞，而被發現的生命體有極大的嫌疑。如果
隨便地使其增殖的話非常危險。
這個名為「metroid」的生命體本來打算帶回地球，卻被宇宙海盜奪取了！
「metroid」如果被海盜拿來增殖作為武器的話，銀河文明將會被滅亡。因此在聯邦警察
拼命的搜索下，發現了海盜的據點地「要塞行星zebesu」，並進行了總攻擊，然而，遭到
海盜頑強的抵抗，而無法攻陷。而在要塞中心部metroid的繁殖穩定的進行著。
聯邦警察決定使用最後的手段，是讓宇宙戰士侵入到zebesu內部，破壞作為要塞中心的
母腦(mother brain)。而被選上的宇宙戰士是「莎穆絲·艾倫」。他是最優秀的宇宙戰士
，解決了許多被認為絕對不可能處理的事件。是全身接受機械人強化手術具有超能力的人
物。可以吸收敵人力量的宇宙套裝也讓海盜們感到恐懼。可是他的真正的正體充滿神秘的
謎團。
行星zebesu是天然的要塞，外側被特殊的岩石覆蓋，內部有著複雜的迷路。而且，海盜
佈置各種各樣的"陷阱"包圍著，到處有怪異的海盜的手下等待著。莎穆絲成功侵入zebesu
。但剩下的時間不多了，莎穆絲能打倒metroid，拯救銀河文明嗎？