剛好一直有在追蹤疫苗相關資訊所以回答你一點
武漢肺炎+英國DLC版的學名目前訂為
SARS-CoV-2 virus B117 strain
這裡可以看英國公布的病毒基因資訊
https://www.gisaid.org/references/gisaid-in-the-news/uk-reports-new-variant-te
rm
縮網址:
http://bit.ly/3nTxHDe
在討論更深度的資訊前要先釐清一些資訊
這個變種在9月就偵測到了, 至11/30為止的採樣顯示出早就突變無數次
被稱為英國DLC的原因只是因為這些突變種有共通變異點
https://i.imgur.com/sX73kas.png
如何看這個圖:
B117系列早就有無數的分支, 這些還是簡化過的
簡化的方式為以核苷酸變種用圈圈來表示
圈圈越大代表連帶性的突變量越多
一個圈圈的突變點也會有所不同, 只是因為有共同核心變種所以才歸類為一個支線
而資料來源有部分還是來自其他國家的樣本 (橘黃色圈圈)
所以這病毒早就已經離開英國了
現在才想封英國根本是表面功夫而已
在這版本出現前, 武漢肺炎平均一個月會有2~3個核心變異點出現
而這版是因為累積出23個主要突變點所以才被整合成英國收藏版
這裡列出他最主要的指標變異點(上面的圖有標示出來)
gene nucleotide amino acid
ORF1ab C3267T T1001I
C5388A A1708D
T6954C I2230T
11288-11296 deletion SGF 3675-3677 deletion
spike 21765-21770 deletion HV 69-70 deletion
21991-21993 deletion Y144 deletion
A23063T N501Y
C23271A A570D
C23604A P681H
C23709T T716I
T24506G S982A
G24914C D1118H
Orf8 C27972T Q27stop
G28048T R52I
A28111G Y73C
N 28280 GAT->CTA D3L
C28977T S235F
其他蛋白基因:
Orf8基因 (open reading frame 8)
這個在各個變異種之間其實是很不穩定的部分
今年中早就在世界各國檢測到, 其中最知名的是新加坡第二波疫情
當時還搭配Orf7b變異, 不過該病毒株隨著新加坡的管控下也消失了
其不穩定性要拿這來針對有點不太適合
這次的變異還有附加提前中斷基碼, 有可能讓這蛋白完全失去效用
相關文獻: http://bit.ly/34Nmnkw
N基因 (Nucleocapsid)
這個是棉花棒戳你鼻孔/喉嚨深處採集來偵測是否有被感染的蛋白基因串
此基因是用來管理已被感染細胞中的病毒生產過程
相關文獻: http://bit.ly/3hqqyHZ
ORFlab (orf1a polyprotein)
這個你可以把它看成武漢肺炎的血統證明
由於這個基因的獨特性
在你的戳鼻孔/深喉嚨樣本中同樣會被拿來偵測是否被感染
相關資訊: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/43740578
Spike 棘蛋白突變
這個刺蛋白的突變比偏重
多數是已出現過但是效果未知的趨同演化
如:
目前偵測到的南非DLC 501.V2 也有類似的N501Y變化
HV 69-70 deletion跟之前新聞有播的丹麥水鼬疫情一樣有出現過
同樣的這兩個也是這次聳動新聞標題的主因
傳染力是否有增加?
在有更多實驗資料前都是未知數
單純因為英國偵測方式一直都依賴N, Orf1ab 和 S蛋白
而因蛋白突變造成其中一個失效, 也因此多出了偽陰性
加上N501Y會影響到RBD (受體結合區域) - 跟細胞結合的部分
之前武漢肺炎綜合抗體 LY-CoV555/LYCoV016 的研究指出要是RBD有變化就可能會影響效
果
雖然這研究並不包含N501Y區塊
左++右++就莫名的出現了70%傳染力這個說詞
說實話沒人知道這數字怎麼求來的
個人猜測英國主流病毒株為這串只是因為偵錯率過高的關係吧
RT-PCR本來就會隨著感染天數和是否有症狀而有上下起伏的偽陰性
從第一天的100%到第九天的13%都有
要是其中一個指標出錯的話很容易就被誤判為陰性
資訊來源: https://bit.ly/3nU8GYB
如果你看這資料, 你可以看到7月左右就有類似的突變, 9月開始冒出一點, 11月才暴增
目前各疫苗商都說他們不認為會影響到疫苗效果
尤其Modern / Pfizer 由於它們是讓身體產生特定S蛋白碎片來形成抗體
要是他們沒用到變更的部位應該就不會被影響
Oxford/AstraZeneca (阿斯利康)的疫苗用的是猴子身上取來的病毒經由基因改造而製成
的
跟另外兩家的比起來應該比較可能被影響到
效果算是未知 (不過官方都說沒影響了就觀望看看)
這幾天各家疫苗商也都在測試英國DLC, 等假期過後看公開資料就明瞭了
※ 引述《hayate232 (CY)》之銘言：
: ※ 引述《leo0873 ( )》之銘言：
: : 最近 很多新聞都在報道 新冠肺炎 英國變種病毒的新聞
: : 而前一段時間 也有許多關於新冠肺炎疫苗的報道
: : 但是開始有人想問
: : 到底新開發出來的新冠肺炎疫苗
: : 防的住 來自英國的 新冠肺炎 英國變種病毒嗎？
: : 有沒有八卦阿？
: 不就跟流感疫苗一樣，猜病毒株阿..
: 但這個RNA病毒很強，傳染力點到最高，致命性最低，讓他有足夠的時間感染 變異
: 就流感的經驗來看，就算猜錯病毒株，也有一定的防護力。
: 只是這個傳染力太可怕..真的不知道要多久傳染力才能降到現在流感等級
: 解藥這東西就別想了QQ

太長了先推吧

sinovac的呢？

乾 我對RNA病毒認知只有國中程度拉 但還是給推

英國廢物滾回台囉

嗯嗯 好文推，所以有人說不要說strain 要說B117 lineage我不覺得AZD1222比較會受影響，他們是用 adenovirus當載體包S-protein DNA template另外分享目前我看到最好的 threadhttps://bit.ly/34JK3pS

我都唸IKEA 這種沒辦法回

推

推認真文，希望疫苗效果不被影響...

推

高二之後沒唸過生物的人看不懂啦 但是專業給推

我也這麼覺得

專業給推 但我看不懂

推

結論勒

感謝 請問假期過後還會分享測試結果嗎

雖然看不懂 不過知道了還沒個結論這點

推

結論他有寫啊，專家評論目前的突變株應該不影響現在

結論有點怪, 你自己都寫了新變種有好幾個S protein mutations, 你怎麼會覺得針對spike設計的Pfizer和Moderna mRNA

推

目前突變不夠多，一個 S-protein很大，疫苗所引起的免疫系統會辨一堆S-protein的片段區域。簡單講就是一個藝人去做小針美容你還是認得他的臉。

主要是RBD內的RBM啦，有疑慮是因為N501Y這個突變讓疫苗有不確定性，因為這是一個重要結合點位，N501是確認會影響細胞中和，但N510Y沒有文獻證實。另外那個不叫做學名，只能說是這一個lineage 或strain的代號另外一個月有2～3個核心突變？這個資料來源在哪？這個數字不太對，現在全世界主要的其實也只有D614G這個分支，其他分支也是了三個月出現一次，而且也消失了。如果要看long term 的話其實很低

推

武漢肺炎pro

專業