金庸小說中內功基本可說是武功代表，要比較全真跟武當武功就先從內功來比優缺
全真優點:
被譽為天下武學正宗，當初馬钰只傳幾個口訣給郭靖郭的武功就飛快的成長，練
降龍18掌時被洪七公讚許:這就是了，否則你短短一個多月，怎能把我的降龍十八掌練
到這樣的功力。被旁白認證跟王重陽同為天下第一的林朝英再創玉女心經時，也因為
全真內功博大精深，欲在內功上創制新法而勝過之，真是談何容易？而別尋蹊徑，自旁
門左道力搶上風。天下武學正宗跟博大精深已經給全真內功極高的評價了
全真缺點:
周伯通道當年我若不是失了童子之身，不能練師兄的幾門厲害功夫就道盡全真的缺點
雖然這跟武當沒有什麼差別但不能練幾門全真武功比不能練純陽無極功影響更大，
而且照周伯通講這幾門應該是能跟5絕等級抗衡的武功不能練真的太吃虧了。再加上小
龍女說過:這些全真老道的功夫，練起來可不容易，當年師父也不十分明白，我更加沒能
領會多少。已說明全真內功修練上很吃悟性
武當優點:
武當內功其實比全真內功更容易上手，張翠山再無忌5歲時就能傳他練武當內功基本
也沒練出問題就說明武當內功門檻很低，就算是武當九陽功無忌小時也能練習，武當
內功再倚天也有以威力而論，可算得上當世第一的旁白認證。
武當缺點:
張無忌翻九陽真經時已把武當內功的缺點都講出來了，就是連九陽的十分之一都沒有
。要知道九陽神功是武當內功的基礎，但這基礎連十分之一都沒這就顯的太薄弱，這
也間接的說出武當內功不如少林內功的事實。再加上純陽無極功要童子身才能練，好
再張三豐有開發太極心法能補上不足。
總結
全真內功上限很高但門檻也很高，武當門檻低但上限只有張三豐練到