簡單講一下疫苗的原理
疫人體內有很多種免疫機制
其中一種叫做體液免疫，簡單來說就是藉由抗體引起的免疫。人體偵測到外來的物質，
也就是所謂的抗原(antigen)後，會有所謂的抗原呈現細胞(APC, antigen presenting
cell)來將這些物質呈報給B淋巴球。B淋巴球會大量製造針對此抗原的抗體，並特化成為
漿細胞(加開產線生產抗體)並開始分裂，讓身體對付這種物質。
被抗體結合以後的抗原，就像被插了帶有GPS功能的警報器，本來處在潛行狀態的抗原，
這時警報大作，所有警察(巨噬細胞、嗜中性球...)全都會蜂擁而上，張開血盆大口。
等到亂事平定，身體會記住這次引起騷動的抗原，下一次一樣的東西侵入身體，就不需
要再重新認識，可以直接大量生產一樣的抗體。
抗原是什麼？身體內外充滿著抗原，可能是一些無害的分子，也可能是有害的病原體，例如細菌，病毒，真菌表現在其表面的一些蛋白質，多肽，多醣等等，或者它們製造出來的物質...只不過大多數無害的抗原，身體會藉由免疫調節反應，學習到不要對他們進行激烈的免疫作戰，如果失敗的話，就會引起自體免疫疾病、過敏等問題。
初次製造抗體的速度比較慢(需要兩週左右抗體的量才能達到高峰)，身體可能來不及如上述過程產生特異性的抗體，就
崩潰了，例如產生嚴重的感染或以及一些併發症。
當然能夠撐過感染走完上述體液反應流程的話，下次理論上就不會怕一樣的東西了。
疫苗的原理就是找出某種病原身上能夠被身體辨認的記號，先給予身體一次經驗，讓身
體記得，一旦碰到真正的敵人，就能夠更加迅速有效地做出反應。
因為真正的病原體太強，通常可以把病原體，例如細菌或是病毒，拿來處理一下，
降低其毒性或是活性，再打入人體。弱化後的病原體沒辦法引起嚴重的疾病，卻可以給
身體辨認出敵人的經驗。這就是所謂的減毒疫苗(attenuated vaccine)。
又或者，我們知道病原體哪些東西可以被身體認得，就擷取下來，用生物科技的技術大
量生產，然後做成疫苗。這種東西只是病原身上的片段，並沒有致病能力，但一樣可以
讓身體認得該特定病原體並產生抗體。這是結合疫苗。(conjugated vaccine)
當然，如果減毒疫苗毒性不夠弱，或病人免疫力太差，或者疫苗本體在病人體內突變，
讓自己重新偉大。減毒疫苗可能反而讓病人生病並產生一些併發症，甚至造成流行。
可參閱：
https://shorturl.at/dBLT7
一般情況下，接合疫苗是比較安全的，但1.需要生物科技技術的門檻較高 2.有時候這種方式帶給
身體的免疫保護力比不上減毒疫苗。
了解疫苗的原理後，我們來看看蟲草菌感染。
首先這是真菌，屬於真核生物，變異速度比不上細菌，更比不上病毒，遑論變異更快速
的RNA病毒。製作疫苗的難題之一就是，你千辛萬苦做出疫苗，結果病原體突變，抗原結
構發生改變，你的疫苗就沒用了。
總之製成菇菇疫苗應該是可行的，但可能當初疫情爆發太快，疫苗還沒做出來，世界就
滅亡了，各大藥廠來不及完成疫苗。
艾莉的確可能因為感染到突變過的蟲草菌，導致身體有了免疫力，就好像打了一劑天然
的減毒疫苗一樣。
只是按常理來看，世界上幾十億人被感染，如果真的存在減毒免疫的途徑，那不太可能
只有艾莉一個個案。不過在那個末日後通訊斷線的世界，找到其他個案的難度的確也大
幅上升。(正常情況下，醫界找到這種個案一定馬上寫case report發佈到期刊，各國的
醫界不到一星期就會知道並開始試圖尋找個案)
最可能的情況是艾莉的免疫系統或身體其他細胞有一些突變，讓她躲過發病並產生免疫
。
例如鐮型紅血球貧血的病人會對瘧疾有較高的抵抗力，大概是這樣的概念。有興趣的人
可以自己Google。
好，終於要來回答最重要的問題。製造疫苗需要殺掉艾莉合理嗎？
要疫苗，那就拿一些艾莉身上的菌來研究，問題是：
要拿菌的話，感染者滿地都是，拿他們的就可以了，拿死人的也不會有問題。何況如果
艾莉身上真的是特殊菌株，可能你費了一番功夫做出來的疫苗，對其他人沒有用。所以
根本不需要艾莉，即使需要，也只要做個切片、抽吸腦脊髓液就可以。你他媽不是連CT
都切下去了嗎？(還是只是X光片我忘了)
再來，可以抽艾莉的血。很多疾病感染人的時候，血中有機會找到抗原或一些血中的病
體，血中有細菌，叫做bacteremia，血中有病毒叫做viremia，血中有真菌叫做fungemi
a，反正血液裡就有很高機會找到病原體。根本不用大費周章找到大腦去。
拿到病原後，要做接合疫苗或減毒疫苗就是科學家的事情了，和病人已經沒有關係。
開開腦洞好了，假設血液中沒有菌體，腦中的菌體卻因為艾莉有很多動脈瘤*而沒辦法開
刀或是切片拿，內視鏡也拿不到，抽腦脊髓液也抽不到，身體其他部位也都沒有找到可
用的菌體。這的確可能會形成為了抽到菌體不得不犧牲艾莉的情況，換個角度說就是，
病人die on table的機會很高。
只是，從一代看來，火螢找到艾莉，一直到喬爾醒來被告知艾莉會為了研發疫苗死掉這
段時間不過幾小時，了不起一天。
我是不太相信火螢的醫療團隊真的已經做了所有能做的事，才能確定找不到病原，而只
有開刀一途。如果是這樣，那這顯然就是一個草率的決定。而疫情爆發都已經二十年了
，等個幾天做一些抽樣確認結果是有很難嗎？
再退一萬步，前面都已經說了，要做疫苗根本不必，甚至不應該拿艾莉的身體來做實驗
。
而如果蟲草菌的致病機轉特殊，導致疫苗難以製成。艾莉是因為身體有某種突變，才導
致她能夠免疫，那唯一的做法就是用CRISPR/cas9 之類的科技去修改所有新生兒的基因
，讓大家都跟艾莉一樣。
不用說，首先世界末日沒有這個資源，再來，疫情爆發的2013，這種技術還沒成熟，疫
情導致世界一切停擺，TLOU裡面的世界，不可能有這種技術。
經過以上論證，為了全人類好，艾莉必須死這個命題根本不成立；艾莉不死，人類不會
好這個逆否命題同樣不會成立。因此一代的劇情根本不合理，但是因為一代的劇情其他
部分做得太好，這根本不重要。
尼爾二代再次強調這個根本不成立的命題，就只是想為奄奄一息的二代劇情合理性以及
正當性，徒勞地做些什麼而已。
*的確有一種動脈瘤的病因是感染造成的，醫學上稱為真菌性動脈瘤。但事實上這是一個
將錯就錯的名字；形成真菌性動脈瘤的原因絕大多數是因為細菌感染，而非真菌感染。
資料來源:自己所學以及若干醫學網站。
※ 引述《appleball200 (我帶把的不要再把我了orz)》之銘言
: 有網友在討論
: 做疫苗艾莉必死 在現實下合理嗎？
: 小弟妹是看實況雲玩家 斗膽來討論看看
: 當然一定有人說就劇情幹嘛深究
: 但若在現實基礎上加一點想像
: 能夠說的通的話更有趣阿@[email protected]
: 直接結論
: 小弟覺得做疫苗艾莉要死這設定是有可能的
: 以下是假設：
: 1.感染艾莉的是突變的低活性菌株
: 此菌株具有一般菌株的特點
: 但是活性較低
: 感染到一定程度就無法繼續擴張
: 而與艾莉共存
: 現實共存例子： 皮膚上表皮葡萄球菌
: 腸內大腸桿菌 陰道內酵母菌
: 2.獲得對低活性菌株的抵抗力
: 也就獲得對一般菌株抵抗力
: 現實例子：牛痘與天花
: 2-1. 艾莉在被咬之前就已經默默被感染
: 才有免疫力
: 現實例子： HSV 盛行率可高達40%
: 但多數人沒症狀根本不知道被感染
: 最近的covid2019也是
: 3.艾莉身上低活性菌株活性太低（太廢）
: 周邊抽血無法抽到孢子
: 阿不然直接抽血拿孢子培養就好
: 現實例子：HIV 控制良好者無法驗到 HIV
: （病毒濃度低於儀器極限）
: 且傳染力大幅降低
: 但其實還是有被感染
: 4.艾莉身上的菌株長在腦部非常刁鑽的位置
: 導致開刀取出相當困難
: 無法在不死亡下取出菌株
: 這我覺得是說的通的
: 就算是神外專科醫師
: 也未必對所有手術方法都非常熟悉
: 更何況是資源缺乏的末世
: 可能沒有開顱手術需要的一些關鍵工具
: 而導致無法保證艾莉的生命
: 這設定個人是可以接受的
: 以上
: 為了艾莉會不會死而輾轉難眠的
: 你各位板友們
: 希望可以帶來一點幫助@[email protected]