[問題] 迴圈問題(ncdf檔)

作者: AndrewShi (沒有妳的我)   2019-05-09 18:52:14
[問題類型]:
程式諮詢(我想用R 做某件事情,但是我不知道要怎麼用R 寫出來)
[軟體熟悉度]:
入門(寫過其他程式,只是對語法不熟悉)
[問題敘述]:
各位大大好,小弟我目前有2個矩陣(原始為list)的數值資料,其中一個為時間的
index(第幾筆),另一個為各別分配的權重,我要做的事是將這2個矩陣的資訊套用在一筆
降雨資料(netcdf檔)上,由下圖的2個矩陣(時間index.權重)的資訊為例,也就是我要將
原始的降雨資料的第一天(筆)以第1天的降雨值(每個網格點)x0.8334249,加上第9830天的
降雨值x0.12252973來取代,以此類推。
而小弟我目前卡在不知道該怎麼把矩陣對應的關係(第1天的第1個時間index乘上第一
個權重)放入迴圈中,下面的程式碼中是以analog.indices表示時間的index,weights表
示權重,可能程式碼的邏輯非常怪異,我上網查或許用apply系列的指令較適合,但我也
較少用apply系列的指令,因此較不熟悉,還煩請大大們指點和較詳細的說明,也非常歡
迎引導式教學,謝謝。
2個矩陣以及降雨的資料放在此:http://0rz.tw/JI056
https://imgur.com/Q4rRKi9 (時間index)
https://imgur.com/YJFXtr5 (權重)
[程式範例]:
library(ncdf4)
library(data.table)
memory.limit(size=50000)
analog.indices <- A[[1]]
analog.indices <- matrix(unlist(analog.indices), nrow=length(analog.indices),
byrow=T)
weights <- A[[2]]
weights <- matrix(unlist(weights), nrow=length(weights), byrow=T)
HIRAM_WRF_data <- nc_open("C:\\Users\\TOM\\Desktop\\R(資料庫)\\WRF(動力降尺度
資料)\\T2WHIRAM_c384_amip\\197901-200512_pr_axis_time_domain.nc")
print(HIRAM_WRF_data)
hiram_wrf_lon <- ncvar_get(HIRAM_WRF_data,"lon")
hiram_wrf_lat <- ncvar_get(HIRAM_WRF_data,"lat")
hiram_wrf_time <- ncvar_get(HIRAM_WRF_data,"time")
hiram_wrf_pr <- ncvar_get(HIRAM_WRF_data,"pr")
pr <- array(NA,dim=c(length(hiram_wrf_lon),length(hiram_wrf_lat),2))
for(i in analog.indices[1,i]){
for(w in weights[1,w]){
if(i==w){
pr[,,1:2] <-
ncvar_get(HIRAM_WRF_data,"pr",start=c(1,1,i),count=c(41,77,1))*w
}
}
}
View(pr[,,1])
[環境敘述]:
[關鍵字]:
迴圈 ncdf檔
作者: andrew43 (討厭有好心推文後刪文者)   2019-05-09 19:08:00
analog.indices的V1有重覆,對嗎?例如V1==10另外,這用for會好寫很多。晚點再看看權重表格如何和其他對應?說清楚一些
作者: AndrewShi (沒有妳的我)   2019-05-09 20:41:00
andrew大~對,但應該不多,analog.indices那個表格最左邊那一列是原始資料的天數,右邊這兩列則是所有資料裡和這天最相近的2天。權重的表格是和analog.indices的表格相對應,也就是兩者的[1,V1]做相乘,兩者的[1,V2]做相乘,再相加,只是做相乘的時候analog.indices的[1,V1]不是取那個數字,而是取那天的降雨資料出來和權重的[1,V1]這個值做相乘,[1,V2]也是一樣。
作者: andrew43 (討厭有好心推文後刪文者)   2019-05-09 21:28:00
那麼,遇到第10天時怎麼算?能把實際數字寫出來嗎?
作者: AndrewShi (沒有妳的我)   2019-05-09 22:15:00
一樣呀,第10天就是拿第10天的降雨值乘上權重[10,V1](0.764485),加上第4407天的降雨值乘上權重[10,V2](0.203293)相加而得。
作者: andrew43 (討厭有好心推文後刪文者)   2019-05-09 23:31:00
但有2個第10天不是嗎?有重覆要怎麼處理?
作者: AndrewShi (沒有妳的我)   2019-05-10 01:20:00
那是第10天被選了2次,意思是原始資料的第10天和第11天很像,所以原始資料在第10天選了自己本身,在第11天時也選了第10天,右邊這兩列的數字是選出跟原本資料(最左列)那天最相近的2天出來,所以基本上會挑出自己本身(第一列和第二列數字幾乎一樣);然而原始資料的第10天(最左邊的列)是沒有重複的。
作者: andrew43 (討厭有好心推文後刪文者)   2019-05-10 08:38:00
ok。那麼,雨量資料有9862天,但對應表格有10227列,而你上述對應表格的列號就是對應第幾天。為什麼?例如,對應表格第10227列的作用是什麼?或是你新創出的雨量資料要有10227層?是的話,參考 https://ideone.com/2S9KgX
作者: AndrewShi (沒有妳的我)   2019-05-10 11:11:00
表格的列號正常的話也只有9862列,後面是我新創的,忘記刪掉,抱歉造成你理解上的誤會,再次感謝andrew大,code的部分我會再好好的研究。
作者: andrew43 (討厭有好心推文後刪文者)   2019-05-10 11:18:00
那把新array的dim改一下就可以了
作者: AndrewShi (沒有妳的我)   2019-05-10 13:20:00
恩恩,andrew大,想再請教你如果我每天的analog.indices和weights都有30個的話,col.names和for迴圈的部分除了自己補足剩下的,該怎麼修改迴圈中$i1.$i2.$w1.$w2的部分讓它自動加總30天呢??
作者: andrew43 (討厭有好心推文後刪文者)   2019-05-10 13:36:00
最直接的想法是雙層迴圈,外面那層照舊走直的,裡面那層走橫的。另一種可以是把權重表格重新整理成特定順序,再利用矩陣乘法做加權。速度應該會快很多但較不直觀。
作者: AndrewShi (沒有妳的我)   2019-05-10 15:16:00
我想到的是第一種(雙層迴圈),不知道改成這樣對不對,還請andrew大指點。https://imgur.com/ci54KFs
作者: andrew43 (討厭有好心推文後刪文者)   2019-05-10 15:19:00
不對喔。錯在w那層沒有用處,變成只是同一件事做很多次.晚點我寫給你看看
作者: AndrewShi (沒有妳的我)   2019-05-10 15:19:00
因為不知道怎麼把$i1.$i2.$w1.$w2寫成迴圈,所以把i1.i2.w1.w2全改成i和w。
作者: andrew43 (討厭有好心推文後刪文者)   2019-05-10 16:19:00
作者: AndrewShi (沒有妳的我)   2019-05-10 18:04:00
原來是要改成這樣,非常感謝andrew大,最後有2個小問題想請教你,一個是.[1:9862]最前面的那個.是代表前面讀進來的那個csv檔嗎?!另一個是col.names如果i有1~30的話是只能一個一個打(命名)嗎??
作者: andrew43 (討厭有好心推文後刪文者)   2019-05-10 18:06:00
1. 是2. 此例命名不必要,隨便取成as.character(1:30)也行
作者: AndrewShi (沒有妳的我)   2019-05-10 23:38:00
了解,再次感謝andrew大的解答和每次的幫助~

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