1.自強號(包括太魯閣號、普悠瑪號)
七堵→苗栗間157次(PP)
花蓮→臺北→潮州間191次(海線，DR3100型)
潮州→臺北→花蓮間192次(海線，DR3100型)
花蓮→樹林間233次(太魯閣號，逢週日行駛)
樹林→花蓮間242次(DR2900型、DR3000型)
臺中→高雄→臺東間385次(普悠瑪號)
臺東→高雄→臺中間386次(EMU3000型)
關山→臺東間468次(DR2900型、DR3000型，逢週六、日、例假日停駛)
員林→臺北→臺東間472次(山線，EMU3000型)
臺東→臺北→員林間477次(山線，EMU3000型)
2.莒光號
臺東→臺北→潮州間667次(山線，逢週日跨一行駛)
新左營→臺東間707次
3.區間快車
潮州→七堵間1006次(海線)
潮州→七堵間1038次(海線)
七堵→彰化間2005次(山線)
基隆→彰化間2007次(海線)
七堵→嘉義間2013次(海線)
彰化→豐原間2028次
七堵→彰化間2037次(山線)
嘉義→潮州間3023次
豐原→潮州間3035次
蘇澳→樹林間4007次
花蓮→樹林間4013次
樹林→蘇澳間4048次
4.區間車
樹林→七堵間1170次
苗栗→臺北間1288次
斗六→豐原間2272次
枋寮→潮州間3342次
臺東→玉里間4509次(逢週六、日、例假日行駛)