2007年5月 8日，因應第1批3列24輛太魯閣號加入，台鐵進行改點。一年之後，
2008年5月15日，因應第2批3列24輛太魯閣號加入，台鐵進行改點，時刻如下。
註：1087次、1098次、1097次逢週一至五行駛，1092次逢週六日行駛，
1069次逢週五六日行駛，1074次逢週五六日跨六日一行駛。
東部幹線順行
1091 1086 2035 1063 1095 1069 1073
樹林 員林 樹林 樹林 樹林 樹林 新竹
↓ ↓ ↓ ↓ ↓ ↓ ↓
花蓮 花蓮 花蓮 花蓮 花蓮 花蓮 花蓮
註
樹林 0741 ↓ 1032 1410 1614 1721 1957
板橋 0747 0917 1038 1417 1619 1727 2004
台北 0800 0930 1050 1430 1630 1740 2015
松山 0808 0937 1056 1436 1636 1747 2022
七堵 ↓ 0956 ↓ ↓ ↓ ↓ ↓
八堵 ↓ ↓ ↓ 1455 ↓ ↓ ↓
瑞芳 ↓ ↓ ↓ 1503 ↓ ↓ ↓
頭城 ↓ ↓ ↓ 1538 ↓ ↓ ↓
礁溪 ↓ ↓ ↓ 1543 ↓ ↓ ↓
宜蘭 0913 1046 1201 1549 1743 1851 2127
羅東 0921 1054 1209 1557 1750 1859 2135
花蓮 1008 1142 1257 1645 1838 1948 2223
東部幹線逆行
1064 1092 1087 1094 1066 1089 1096 1074
花蓮 花蓮 花蓮 花蓮 花蓮 花蓮 花蓮 花蓮
↓ ↓ ↓ ↓ ↓ ↓ ↓ ↓
樹林 樹林 彰化 樹林 新竹 員林 樹林 樹林
註 註 註
花蓮 0615 1040 1040 1230 1430 1740 1930 2200
羅東 0703 1129 1129 1318 ↓ 1829 2020 2248
宜蘭 0710 1137 1137 1326 ↓ 1837 2028 2256
礁溪 ↓ ↓ ↓ ↓ ↓ ↓ 2035 ↓
頭城 ↓ ↓ ↓ ↓ ↓ ↓ 2041 ↓
七堵 ↓ ↓ 1232 ↓ ↓ 1930 ↓ ↓
松山 0814 1241 1249 1430 1626 1944 2139 0001
台北 0825 1250 1300 1440 1635 1955 2150 0010
板橋 0834 1259 1309 1451 1645 2005 2200 0019
樹林 0839 1304 ↓ 1456 1653 ↓ 2205 0024
西部幹線
1086 1098 1073 1087 1066 1089 1097
員林 彰化 新竹 花蓮 花蓮 花蓮 基隆
↓ ↓ ↓ ↓ ↓ ↓ ↓
花蓮 基隆 花蓮 彰化 新竹 員林 樹林
註 註 註
員林 0724 基隆 1920
彰化 0735 1630 八堵 ↓ ↓ ↓ 1927
台中 0748 1634 七堵 1232 ↓ 1930 1933
豐原 0758 1645 汐止 ↓ ↓ ↓ 1941
新竹 ↓ 1724 1907 南港 ↓ ↓ ↓ 1950
中壢 ↓ ↓ 1932 松山 1249 1626 1944 1955
桃園 ↓ 1755 1941 台北 1300 1635 1955 2005
樹林 ↓ ↓ 1957 萬華 ↓ ↓ ↓ 2011
板橋 0917 1813 2004 板橋 1309 1645 2005 2017
台北 0930 1825 2015 樹林 ↓ 1653 ↓ 2022
松山 0937 1832 2022 桃園 1327 1707 ↓
七堵 0956 1849 ↓ 中壢 ↓ 1715 ↓
八堵 ↓ 1853 ↓ 新竹 1357 1739 ↓
基隆 1859 豐原 1437 2124
台中 1447 2135
彰化 1459 2149
員林 2159