請問我可以買台北-台南
然後從新竹搭同班列車同座位到台南嗎？
還是只能從台南到新竹提早下車？

可以，在找站務員走公務門進站

指定兌換券，是指什麼呢？1F說的是常見的狀況，一般來說縮短搭乘區間，頂多就是不退差額，不至於出現不給搭的狀況。但是有沒有限定起迄站的兌換券....就不是很確定了。