你拋出的疑問非常多
涵蓋了很多層次，所以很難有一本書可以回答你這裡所有的疑問
所以如果要推薦的話建議從比較基礎核心的觀念開始討論
例如：什麼是「物種」？
這個問題在生物學領域的關鍵字是：種概念
你可能覺得：有生殖隔離就可以說是兩個物種。
這是一種「種概念」
不過這個概念顯然無法處理三葉蟲這樣的化石
你怎麼知道三葉蟲生前有沒有生殖隔離？
所以實際上有很多種區隔生物物種的概念
而區分物種，探討物種間彼此親緣關係以及怎麼定義界門綱目科屬種
這就必須觸及「演化」這個觀念
而研究物種間親緣關係，定義分類關係的學科叫做
「系統生物學」
建議你如果真的想確實理解這一系列的問題
可以從我這邊提到的關鍵字開始查詢
然後你可能會看到一本書：
這就是生物學
This Is Biology :The Science of the Living World
https://www.books.com.tw/products/0010763532
注意這本書是滿枯燥的，
請先仔細閱讀顏聖紘教授的導讀再開始讀這本書
或許你也可以直接讀第七章： (目錄如下)
第7章 生物多樣性研究：探討生物學中的What
生物學中的分類法
微觀分類學：劃清物種間的界線
巨觀分類學：物種的分門別類
資料的存取
生物系統
先理解接受了系統生物學的分類邏輯
然後再來看看每一個類群的生物有哪些特徵
會比較不容易產生誤解或是迷思概念
也會比較習慣生物學家常在分類命名上大搬風的狀況 (尤其植物)
對於亞門、超科這種名詞也不會起什麼特殊情感了
※ 引述《jamo (hi)》之銘言：
: 我想找介紹生物分類方法的書
: 界門綱目科屬種
: 是怎麼定義出來的,怎麼分類
: 例如節肢動物,軟體動物的特色
: 順便介紹一下代表性的生物
: 以及一些值得介紹的特色
: 例如節肢動物數量最大,分布最廣的動物
: 或者亞門,這種物種外觀不同,但生殖不隔離等等
: 找了很久,
: 用"生物分類學"在博客來北市圖找過找不到~
: 科普書,教科書都行
: 簡中繁中請推薦,外文沒辦法
: 感謝~~
比較詳細要討論節肢動物等生物特徵要找「動物學」或「昆蟲學」教科書
雖然裡面介紹昆蟲或是其他動物特徵不會有過時的問題
不過講親緣關係，A和B生物關係比較近的時候可能較老的書會有錯誤
(因為新的研究認為OOXX怎樣怎樣所以A生物應該分去另一個目/科)
這就是為何需要先建立系統分類學的觀念
再看不同類群生物的書籍
關於物種外觀不同，生殖不隔離的例子
這不就在說人類嗎？