此預算變更在3~4月份提出，在5/21由國土交通省核定通過
北陸新幹線(金澤~敦賀段)
https://www.mlit.go.jp/common/001283467.pdf
原先建設預算為1兆1858億日圓，變更預算後提高至1兆4121億日圓(提高2263億日圓)
提高預算的外部原因
人力成本(物價、消費稅)提高 ↑977億日圓
因應東日本大震災後所訂定的耐震設計而提高建設成本 ↑869億日圓
內部原因
與地方政府達成新幹線建設協議(如縮短建設時間)等相關預算支出 ↑607億日圓
在進行事業審查時進行地質條件探勘所產生的相關預算支出 ↑159億日圓
預算降低部分
土地購置成本以及挖掘後的土方石運送成本降低 ↓349億日圓
九州新幹線(長崎段，不含佐賀路段)
https://www.mlit.go.jp/common/001285015.pdf
原先建設預算為5009億日圓，變更預算後提高至6197億日圓(提高1188億日圓)
提高預算的外部原因
人力成本(物價、消費稅)提高 ↑518億日圓
因應東日本大震災後所訂定的耐震設計而提高建設成本 ↑109億日圓
內部原因
與地方政府達成新幹線建設協議(如縮短建設時間)等相關預算支出 ↑439億日圓
在進行事業審查時進行地質條件探勘所產生的相關預算支出 ↑297億日圓
預算降低部分
挖掘後的土方石運送成本降低 ↓175億日圓