事實經過：
以下是我和服務單位(嘉義某醫院)簽的契約書
http://ppt.cc/9nXc
http://ppt.cc/OGkj
http://ppt.cc/WivD
http://ppt.cc/fdNT
http://ppt.cc/sXLU
http://ppt.cc/HlYp 離職通知書
http://ppt.cc/H69a 違約金收據
因某些原因決定離職，由於服務已超過三年，所以需要30日前通知。
我於今年7/18(五)告知主管，他說要我7/21(一)再寫離職書。
我順便順離職書上的離職日期要寫8/21嗎？他跟我說寫8/15即可。
結果昨天(8/15)辦離職時，醫院說我沒有遵照30天前告知離職的規定，
並罰我違約金，我只好用特休把它補掉了。
另外，我的合約是到104/03/28，所以是提前解約，
依契約書第五條寫到如於應服務期限屆滿前離職，須賠償六個月的簽約金。
這條違約金是「醫院支付我培訓(含公假參訓暨相關課程費用等)之懲罰性違約金」，
但我今年參加的培訓課程僅花費一、二千元，卻被罰六個月的簽約金。
如果不付違約金，醫院就扣著我的證照不還我，
因為我8/19就要到新的醫院就職了，只好先付給他。
問題：
1.因為我是依主管說的日期填寫，並沒有違反未提前30天通知的規定，
醫院是否不應該罰我違約金？我用特休把這件事解決了，能夠把特休要回來嗎？
(沒請完的特休可以換成薪水)
2.契約第五條是否合理，我有機會把已繳的違約金要回來嗎？
3.我應該到哪個單位申訴？是勞委會嗎？
由於我新的工作8/19(二)就開始了，僅剩週一一天可以解決，
來得及解決問題嗎？
先感謝各位幫 小弟/小妹 解惑或提出建議，如內容尚有不足，盼請提出需補充之處。