在繼承管領的細川信良於元龜二年十二月晉見足利義昭,獲賜昭字改名細川昭元後,正式
倒向了足利義昭跟織田信長一方(兼見卿記),反出了信長包圍網,因此和三好三人眾等交
惡。在元龜三年四月十三日時,三好義繼聯合三好政勝跟香西元成攻打細川昭元所在的攝
津中島城,在周邊設立付城進行包圍(年代記抄節)。
三好義繼同時也透過本願寺一方斡旋,希望讓細川昭元交出人質進行和談,雙方展開接洽
(誓願寺文書),但隨著三好義繼轉往進攻交野城時,織田信長率領大軍救援,逼迫三好義
繼退回若江城,細川昭元跟三好義繼的和談隨之破局(顯如上人御書札案留)。
同年八月十八日,三好義繼聯合本願寺一方的下間賴充、下間賴純、下間賴廉、下間賴照
、下間賴龍一同發兵包圍中島城(加能越古文叢),兵力達兩萬之眾,細川昭元雖出城野戰
不敵逃回城中,戰死者甚多,後在十二月二十日時,連松永久秀也出兵加入對中島城的圍
攻(年代記抄節)。
細川昭元守在中島城遭到三好義繼聯合三好三人眾、松永久秀、本願寺宗徒聯合的大軍包
圍長達六個月,雙方屢次接戰死傷不小,但長期包圍下,城中通路被斷糧食告竭而再難堅
守(日本耶穌會年報),細川昭元在隔年二月二十七日時終究不敵而棄城,領殘餘士卒退往
界鎮,織田信長安排細川藤孝持續跟細川昭元聯絡,並供應他鐵炮、彈藥跟兵糧,以及金
子一百枚至兩百枚(細川文書、尋憲記)。
中島城失陷後,足利義昭也在當年三月正式表態
赦免三好義繼跟松永久秀等人,轉為支持信長包圍網。細川昭元則完全倒向織田信長一方
,後在當年七月的織田信長攻打足利義昭的槙島城之戰中率兵從界鎮出動支持織田信長,
在戰後入駐槙島城。