您問台灣宮廟是否有受日本神社影響。
我認為您應該要先定義什麼叫影響，好險您自己先給了一些指標
譬如繞境活動 神轎 還有護身符
以下網路隨手查查
先回答台灣的神明遶境是否起源於日本。
否。
至少以著名的大甲媽祖遶境而言，清代就有了。
http://www.folktw.com.tw/culture_view.php?info=102
好的，起源與日本無關。那活動內容是否有受日本影響呢？
答案是曾經有。摘要 (來源同上)
> 北港媽祖遶境活動場面浩大，其觀賞重點為「藝閣」......
> 日治時期藝閣多為藝妓所扮演，現則由兒童妝扮......
> 以前是以人力抬閣，之後改牛車或板車裝閣，現則以花車裝置。
而且按下文考證 (注意連結是 pdf 檔!!!)，
你現在看到的繞境活動內容，可能要算在國民政府時期：
http://libwri.nhu.edu.tw:8081/Ejournal/AZ01000801.pdf
第12頁：
北港媽祖遶境...... 最具特色者為"報馬仔"的裝扮......
民國五十四年北港秀才蔡川所設計...... 極富特色的一項傳統。
再回答中國是否也有神明遶境。
有。福建很多，資料來源在下面。江蘇陝西也有。
https://www.zhihu.com/question/29317573
https://youtu.be/LQaoWhiK9Io
上面這兩個連結，也同時回答了您關於神轎的疑問。
中國的神明遶境還有神轎，是不是其實起源於我大台灣的跨海教學示範，
這就有請強者出示資料證明了。
關於護身符嘛... 不好意思我就不找資料了
只能說 如果你分別拿過日本神社跟台灣宮廟的護身符，你就知道差很多
應該是各自發展。
先說點搞笑
從宮廟到現在都沒有可愛的巫女，我保證日本神社絕對沒有影響到台灣宮廟。哈哈
最後說點認真的，
這類民俗活動，在中國大概被視為封建餘孽，過去肯定只有被打壓的份，
其實就算是台灣，也是到這二十年內，
才因為提倡觀光與重視本土化，其地位才有所提升。
從這經驗看，我想為了賺觀光錢，這類活動以後可能也會逐漸在中國復興起來吧。