http://udn.com/news/story/9/1900765
有民眾發現，高鐵南港站通車後，南港到台北票價是40元，但如果是從台中搭到台北是700元，搭到南港是750元，等於是同一段台北到南港有40元和50元的差別，遭民眾質疑票價不公平。
除了台中到南港會多10元車費之外，像是苗栗、彰化也都有相同現象，另外，板橋到南港則是70元，扣除板橋到台北40元，台北到南港這一段是30元票價，民眾投訴時表示，同一段竟然有三種不同價格，這樣根本不公平，並決定以後要買兩段票，例如分別買台中到台北以及台北到南港兩段車票，可以有省10元的小確幸。
台灣高鐵公司解釋，根據票價公式計算，每人每公里是4.386元，台北到南港距離是10公里，所以應該是43.86元，採取個位數的四捨五入，定票價為40元，反觀台中到南港經過公式計算，170公里乘4.386元，結果是745.62元，剛好可以四捨五入變成750元，其實不同路段因為四捨五入後，有的路段公式計算便宜，有的路段比公式計算貴一點。
至於為何是個位數四捨五入，讓個位數都是零，台灣高鐵公司解釋，標準車廂的票價是零結尾，優待票例如老人票或特價票等經過折扣後會出現尾數5元，對於人工找錢或機器找錢會比較方便，如果標準票價尾數是5元，折扣後會出現3元或2元，自動售票機的找錢機制要重新設定外，也會增加人工負擔。
但如果民眾手持台中到台北與台北到南港兩張票搭車，因為進站時是刷台中到台北的車票，卻要在南港站出站，閘口的設計不會讓旅客通過，台灣高鐵公司建議民眾找站務人員協助，就能以人工認票的方式出閘口。