在確定與亞齊蘇丹國為敵後，鄭文昇開始為即將到來的戰爭做準備。首先他先改建並強化
巴生河口與吉隆坡的堡壘，將原先以夯土為主的原始土壘，改建以磚頭加上夯土為結構，
並具有多層防線的堡壘。而在設計的過程中，鄭文昇更高薪聘請葡萄牙顧問，協助設計星
狀堡壘。在這之中，以吉隆坡最為完整，由外至內的多條防線，層層堆疊，固若金湯。
接著是強化軍隊，鄭文昇決定引入職業軍官協助訓練軍隊。在17市集，東南亞一帶具有多
個日本人町，這些日本人主要以政爭失敗的士族，或是被排斥的日本基督徒為主。這些具
有大量戰爭經驗的日本人也在東南亞各地擔任傭兵，協助作戰，其中最為龐大的日本人町
位於暹羅。鄭文昇透過貿易的關係，找上當時的暹羅國王，並向其闡述亞齊蘇丹國渴望統
一麻六甲半島的野心，並說明這將會為暹羅的南部國境帶來的威脅。這受到暹羅的重視，
因此暹羅國王便允諾文芳商號在暹羅招募日本傭兵。
最終文芳商號透過暹羅的日本人町筆頭—山田長政的協助，成功招募到一支約有150人的
日本人傭兵隊伍，而這隻隊伍由前代筆頭之子—津田彌兵衛所率領，同時加上其他地區招
募的日本傭兵，此時文芳商號的日本傭兵隊伍人數擴充至350人，他們將協助文芳商號訓
練專業化軍隊，並成為鄭文昇手上的菁英部隊。
而在砲兵部分，文芳商號取得葡萄牙人的協助，一向受到亞齊蘇丹國威脅的葡萄牙人樂得
將禍水北引，他們派出30名炮兵專家以及工匠，協助文芳商號成立歐式砲兵並仿製歐式大
砲。同時，鄭文昇也嘗試將文芳商號中部分戎克船將裝可供逆風航行的三角帆，以增加艦
隊的機動力，然而此計畫因華裔水手不習於操作三角帆而作罷。
另外文芳商號也盡可能地從東南亞各地招募傭兵，從緬甸的騎兵到航行於東南亞之間的武
吉斯人，文芳商號盡可能地擴張自己的武力。到了1623年，文芳商號的武裝力量脫胎換骨
，從以武裝商人為主的混合部隊，轉變為具備更多作戰經驗的職業軍隊。這讓文芳商號不
僅戰鬥力大增，同時也可以不受戰爭影響，將商船持續派往各地貿易，不再需要擔心軍隊
因季風貿易所需而分散各地的風險。